如何将SDFile文件批量转化成mol2格式
方法很多,我列举一下: 1、DOCK程序中有个工具叫sdf2mol2,一听这个名字就知道是将sdf文件转化为mol2的.不过你需要和DOCK官方网站申请DOCK程序. 2、Openbabel或者Babel 这个软件非常好用,不过如果sdf是包含多个分子的文件,转化有些麻烦,需要先将多分子文件拆分成单个分子文件,即一个文件中只有一个分子,然后用babel转化就OK了,当然,可以用循环语句批量转化 上面的两种方法都是免费工具可以实现的,下面的方法就需要商业软件的支持了: 3、Sybyl 在Sybyl中读入sdf文件,生成表格,然后把表格中的分子另存为mol2分子即可. 4、MOE
autodock中dlg文件怎么只能看到配体
这里,mol2topdbqs是为受体转化为pdbqs文件.一般来说,mol2是比较通用的文件格式.不过,由于autodock需要考虑受体的溶剂化效应,所以在autodock中用于对接的小分子需要pdbq与pdbqs格式.在autodock中有个程序为mol2topdbqs,…
怎么在sybyl里导入chemdraw分子
现在正在利用sybyl-x进行分子对接,但是现在有个问题就是我先在sybyl中建立一个数据库,然后我把用chemdraw 3D转换的mol2格式的文件直接拷贝到改文件夹中.
怎样用sybyl做docking
ybyl的docking模块是集成的FLexX.首先要将用于对接的受体选择好,保存成ent或pdb格式,最好选择晶体结构中本身就带有原始配体的受体;然后准备小分子库,这里最好事先把小分子加上电荷并进行一下结构的优化,当然也可以做一下相关…
请教各位大神r软件在生物统计有哪些程序包
生物学软件大全 1.三维分子类 RASMOL:观看生物分子3D微观立体结构 RasTop:为RasMol 2.7.1的图形用户界面软件 CHIME:直接在浏览器中观看3D分子 MolMol:将pdb等格式的蛋白文件通过微调,存成普通的图形文件 raswin.exe.gz:…
怎么下载文档
你可以登录百度帐号,进入需要下载的文档页面中,如果是免费的,你点击这个文档下面的,下载该文档按钮,就可以下载了如果是需要财富值的,你按下面的方法来获得财富值来下载文档 1.上传文档,有人下载了…
怎样才能把mol格式的文件变成能够查看的文件?
你可以把那个文件的后缀名改成TX.再打开.在前面的字符就是那个文件的真实后缀名,再改成那个后缀名就可以了
QQ上发过来的文件怎么下载不了
QQ好友发过来的文件是可以下载的,下载方法: 1、首先在手机上登陆QQ进入到的面板; 2、进入面板后,点击面板上方的头像; 3、点击头像后,这时会弹出另一个窗口; 4、在这个弹出的窗口里,找到【我的文件】这一选项,然后打开; 5、点击我的文件后,就进入到我的文件面板; 6、在我的文件面板中,点击【本地文件】; 7、点击打开本地文件后,就能找到刚刚接收或者下载的文件了.
如何下载百度文库里的文件
对于您想要保存下来的文档,您可以选择下载文档.下载文档需要满足以下条件: 1.
将5 mol/L的盐酸10 mL稀释到100 mL,再从中取出5 mL,这5 mL溶液的物质的量浓度为 A.0.5 mol/L B.
A 试题分析:根据稀释定律计算稀释后盐酸的浓度,溶液是均匀的,从稀释后的盐酸中取出5mL,…