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fasta文件怎么打开(fasta文件用什么打开)

如何打开fasta文件

如何打开fasta文件

WINRAR可以解压.zip 文件,如果你不能打开,可能是WINRAR.exe有问题/版本太低/安装过别的解压软件破坏了文件关联,可

以重新安装(高版本)的WINRAR解决问题,你可以试试 WinACE Archiver,很好用的

如你安装了office/ACDsee/photoshop/WINRAR/FlashPlayer7.exe等,通常的(包括文本/图像/电子邮件/网页/压缩/Flash动画等

)文件都可以打开, 有些通常情况打不开的文件需要安装对应的软件,例如:.ISO需安装WinISO/.PDF需安装adobe等等………

恕不能列举--太多了

“有些文件打开后都是一些看不懂的乱码,看不懂的符号”,分为几类情况:一是软件的语言或格式/文字设置不对/有的

字体库不全等,二是打开文件时使用的软件不对,假如用“记事本”打开.exe等文件通常是乱码,前者修改设置,后者安装对

路的软件,三是文件命的后缀(如.txt)与文件不符(如文件应是.exe),四是文件损坏,不能正常读取

matlab中如何导入fasta 文件

matlab中如何导入fasta 文件

#! /usr/bin/perl -w #启用perl

use strict; #启用严格的语法提示

open (IN,”1.fastq”)||die “open error!\n”; #打开数据源文件1.fastq,如果打开失败则终止并输出提示

open (OUT,”>1.fasta”)||die “open error!\n”; #打开输出文件1.fasta,如果打开失败则终止并输出提示

while (){#逐行读取数据源文件1.fastq内容

print OUT “>”,$1,”\n” if (/^@(.*)/); #如果当前行内容以@开头,则将@换为>,后续内容不变

print OUT $_ if (/^[ATGC]/); #如果当前行内容以A或T或G或C开头,则输出改行内容

} #其他fastq行内容不输出到输出文件

close (IN); #关闭数据源文件

close (OUT); #关闭输出文件

各位高手:扩展名为“fasta”的文件是什么类型的文件?谢谢!

各位高手:扩展名为“fasta”的文件是什么类型的文件?谢谢!

可使用 SeaView 打开!

SeaView 是图形化多序列比对编辑器,能够读各种比对格式

Fasta格式,又叫Person(Fasta的主要作者)格式,是SeaView 最简单的格式,使用最多。

FASTA程序是第一个广泛使用的数据库相似性搜索程序。

程序引用取代矩阵实行局部比对以获得最佳搜索。但众所周知,使用这种策略会非常耗费工作时,为了提高速度,在实施耗时的最佳搜索之前,程序使用已知的字串检索出可能的匹配。在速度和敏感度之间权衡选择依赖于ktup参数。它决定了字串的大小。增大ktup参数就会减少字串命中的数目,也就会减少所需要的最佳搜索的数目和搜索的速度。

从2.0版本开始,FASTA对每一个检索的比对都提供一个统计学显著性的评估

如何用mega软件将fasta格式文件转换为phy格式文件?

用mega打开fasta格式文件,弹出序列比对界面,选择菜单Data>Export Alignment>MEGA Format,保存为MEGA格式; 关闭界面,提示是否要打开刚才保存的MEGA格式文件,确认; 弹出Data Explorer界面,选择Data>Export Data,弹出保存设置界面,可以手动调整各种设置比如文件名,其中在Format处有一个向下的选项菜单,可选MEGA、Nexus和Phylip格式,保存即可.

如何把DNASTAR DNA File文件改成FASTA格式

1.editseq中打开.seq文件,file下拉菜单中选择export,选择为fasta格式.多个文件可以全部打开后选择“export all to one” 2.序列名称,回车,序列,保存为txt,直接将文件后缀改为.fas. 3.如你有读取峰图软件,在edit下拉菜单中选择copy sequence中选择fasta格式.

FA文件怎么打开

.fa的文件是一个数据文件.全名是:FASTA Formatted Sequence File. 我查了一些资料,它属于生物信息学中数据文件格式,是一种基于文本用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式.在这种格式中碱基对或氨基酸用单个字母来编码,且允许在序列前添加序列名及注释. 这样的话我建议你使用UltraEdit 32文本编码器试着打开一下,至少它的编码是什么目前我没有文件可测试,呵呵.不过你可以先试一下. 如果你打开后看到的是可读的文本信息或十六进制信息,那恭喜你,你就可以参照下面这个网页里说的格式来对应你想看的东西了.http://baike.baidu.com/view/1487202.htm#2

如何从大fasta文件中找出自己想要的序列

你是想把蛋白的序列提取出来是吗,可以用perl写个脚本,先一个一个的打开pdb文件,然后读出以SEQRES开头的行,并写入到一个新的文件中.

如何打开FA文件

fa文件是生物信息文件,可以用写字板打开

如何将out文件转换成fasta格式

如何下载土豆网和youtube、56网、KU6网等的视频

目前土豆网或者youtube的视频只能在线观看,不能直接下载,但其实在你在线观看后,已经下载在《临时文件夹》中了。

保存已观看的视频方法:

1.在IE浏览器的”工具”中选择”internet选项”

2.在”internet临时文件夹”位置点击”设置”,在新窗口中点击”查看文件”

3.在这个新打开的”TemporaryInternetFiles”窗口中,就可以看到很多文件了。

4.按照文件大小排序,文件格式后缀为flv的文件就是在土豆网或者youtube上在线看完后自动保存下来的文件,这时你只需把该文件复制出来,粘贴到某个地方,再把名字一改~~ 搞定~

5.最后,这种后缀为flv的文件可以用”暴风影音”播放~~

6.有需要别的格式的兄弟,可以下载 千千静听–安装后–把刚才复制出来的“这种后缀为flv的文件”拉进去—然后点击它右键–〈转换格式〉—- 第一行的 《编码格式》 可以修改成 mp3 或者 wma, 然后在 选项—目标文件夹–选好你要保存的路径—最下边–立即转换~~

请教如何从FASTA文件中批量查找序列

把要找的序列名每行一个存放在一个文本’id.list’中,然后运行:perl -e ‘open LST, shift; while( ){chomp; $hash{$_} = 1 } close LST; $/=">"; ; while( ){ chomp; $id = (split)[0] ; if (exists ( $hash{$id} )){ print ">", $_; } } ‘ id.list seq.fa