如何打开fasta文件
WINRAR可以解压.zip 文件,如果你不能打开,可能是WINRAR.exe有问题／版本太低／安装过别的解压软件破坏了文件关联，可
以重新安装（高版本）的WINRAR解决问题，你可以试试 WinACE Archiver，很好用的
如你安装了office/ACDsee/photoshop/WINRAR/FlashPlayer7.exe等,通常的（包括文本／图像／电子邮件／网页／压缩/Flash动画等
）文件都可以打开， 有些通常情况打不开的文件需要安装对应的软件，例如：.ISO需安装WinISO／.PDF需安装adobe等等………
恕不能列举－－太多了
“有些文件打开后都是一些看不懂的乱码，看不懂的符号”，分为几类情况：一是软件的语言或格式／文字设置不对／有的
字体库不全等，二是打开文件时使用的软件不对，假如用“记事本”打开.exe等文件通常是乱码，前者修改设置，后者安装对
路的软件，三是文件命的后缀（如.txt）与文件不符（如文件应是.exe）,四是文件损坏，不能正常读取
各位高手：扩展名为“fasta”的文件是什么类型的文件？谢谢!
可使用 SeaView 打开！
SeaView 是图形化多序列比对编辑器,能够读各种比对格式
Fasta格式，又叫Person（Fasta的主要作者）格式，是SeaView 最简单的格式，使用最多。
FASTA程序是第一个广泛使用的数据库相似性搜索程序。
程序引用取代矩阵实行局部比对以获得最佳搜索。但众所周知，使用这种策略会非常耗费工作时，为了提高速度，在实施耗时的最佳搜索之前，程序使用已知的字串检索出可能的匹配。在速度和敏感度之间权衡选择依赖于ktup参数。它决定了字串的大小。增大ktup参数就会减少字串命中的数目，也就会减少所需要的最佳搜索的数目和搜索的速度。
从2.0版本开始，FASTA对每一个检索的比对都提供一个统计学显著性的评估
matlab中如何导入fasta 文件
#! /usr/bin/perl -w #启用perl
use strict; #启用严格的语法提示
open (IN,”1.fastq”)||die “open error!\n”; #打开数据源文件1.fastq，如果打开失败则终止并输出提示
open (OUT,”>1.fasta”)||die “open error!\n”; #打开输出文件1.fasta，如果打开失败则终止并输出提示
while (
print OUT “>”,$1,”\n” if (/^@(.*)/); #如果当前行内容以@开头，则将@换为>，后续内容不变
print OUT $_ if (/^[ATGC]/); #如果当前行内容以A或T或G或C开头，则输出改行内容
} #其他fastq行内容不输出到输出文件
close (IN); #关闭数据源文件
close (OUT); #关闭输出文件
新手求助：用perl处理fasta文件
不需要你自己重新来写，单枪匹马，刀耕火种，不是一个好的办法。
正好我也在做bioinformatics这块儿，学了点bioperl，我帮你写了个小脚本，用这个工具能很快捷的搞定你的序列！！
我大致给你说下，具体自己上bioperl网站看How To。
现在假定你的序列都为fasta格式，先用
cat *.fasta > single_all_fasta.fasta
将所有fasta序列整合到一个fasta格式中。
然后编写bioperl脚本（你要事先安装bioperl，在debian和ubuntu下很简单，自带源里就有，直接sudo apt-get install bioperl即可，很方便），你参考下：
脚本使用方法为：
perl get_fasta_length.pl single_all_fasta.fasta length.result
脚本我没有测试，一些小错误你可以修改下：
#!/usr/bin/perl -w
use strict;
use Bio::SeqIO;
my $in = shift; #读取文件名称
my $out = shift; #读取输出文件名称
my $flag = 0; #计数
open WH,”>> $out”;
$seqio_obj= Bio::SeqIO->new (-file =>’$in’,
-f =>’fasta’);
while($seq_obj = $seqio_obj->next_seq() ) {
print WH “$seq_obj->desc \t $seq_obj->length\n” ;
print “正在处理第$flag条序列…\n”;
$flag++;
}
print “完毕，共处理$flag条序列！结果保存至$out文件\n”;
close WH;
建议：
学好bioinfo，不会perl不行，不会bioperl更不行，它不仅可以轻松批量处理序列格式，解析blast结果，甚至在脚本里做blast，而且还可以操作biosql数据库。呵呵 建议深入学习下。
phylip 得到的outtree 怎样用mega打开
用mega打开fasta格式文件,弹出序列比对界面,选择菜单Data>Export Alignment>MEGA Format,保存为MEGA格式; 关闭界面,提示是否要打开刚才保存的MEGA格式文件,确认; 弹出Data Explorer界面,选择Data>Export Data,弹出保存设置界面,可以手.
FA文件怎么打开
.fa的文件是一个数据文件.全名是:FASTA Formatted Sequence File. 我查了一些资料,它属于生物信息学中数据文件格式,是一种基于文本用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式.在这种格式中碱基对或氨基酸用单个字母来编码,且允许在序列前添加序列名及注释. 这样的话我建议你使用UltraEdit 32文本编码器试着打开一下,至少它的编码是什么目前我没有文件可测试,呵呵.不过你可以先试一下. 如果你打开后看到的是可读的文本信息或十六进制信息,那恭喜你,你就可以参照下面这个网页里说的格式来对应你想看的东西了.http://baike.baidu.com/view/1487202.htm#2
怎么下载FASTA格式在ncbi
注意;看右上角,有个go…点击展开,有个选项可以选择fasta格式,就可以了..不选默认是nc(NCBI)格式
如何从大fasta文件中找出自己想要的序列
你是想把蛋白的序列提取出来是吗,可以用perl写个脚本,先一个一个的打开pdb文件,然后读出以SEQRES开头的行,并写入到一个新的文件中.
用clustalx打序列文件(.seq)失败是为什么
请用clustalx打开.fasta格式文件.并且文件路径上最好不要出现中文.
如何打开FA文件
fa文件是生物信息文件,可以用写字板打开