hmmer软件,怎么将fasta格式文件转换为sto格式
这问题我也遇到了,网上找半天没找到合适的方案,于是自己写了一个,代码如下 import glob # 都是标准库的东西 import os# 把你想建hmm的fasta文件(比对好的)和本程序放在同一个文件夹里,然后运行本程序直接跑hmmbuild os.chdir(os….
如何用mega软件将fasta格式文件转换为phy格式文件?
用mega打开fasta格式文件,弹出序列比对界面,选择菜单Data>Export Alignment>MEGA Format,保存为MEGA格式; 关闭界面,提示是否要打开刚才保存的MEGA格式文件,确认; 弹出Data Explorer界面,选择Data>Export Data,弹出保存设置界面,可以手动调整各种设置比如文件名,其中在Format处有一个向下的选项菜单,可选MEGA、Nexus和Phylip格式,保存即可.
fastQ格式的格式转换
FASTQ格式与Fasta格式、GenBank等格式可以相互转换.格式转换器如下: Biopython version 1.51 onwards (interconverts Sanger, Solexa and Illumina 1.3+) EMBOSS version 6.1.0 patch 1 onwards (interconverts Sanger, Solexa and Illumina 1….
如何将out文件转换成fasta格式
你好!打开out格式文件,弹出序列比对界面,选择菜单Data>Export Alignment>MEGA Format,保存为MEGA格式;关闭界面,提示是否要打开刚才保存的MEGA格式文件,确认;弹出Data Explorer界面,选择Data>Export Data,弹出保存设置界面,可以手动调整各种设置比如文件名,其中在Format处有一个向下的选项菜单,可选MEGA、Nexus和fastalip格式,保存即可.仅代表个人观点,不喜勿喷,谢谢.
怎么把自测序列转换成fasta格式的啊
你试试DnsP软件,将你的序列复制到txt文本,然后直接改文件名为fas,
NCBI转录组数据能否直接下载FASTA格式序列,windows 32操作系统无法将下载的SRA文件转换成FASTQ文件.
NCBI是可以直接下载FASTA格式文件的,在NCBI检索完毕后,选择send-file-fasta 就可以啦,检索要选择基因或核酸进行
应用MEGA构建进化树时是否需要把目的基因序列与同源基因的序列一起转化为FASTA格式,保存一个文件?
不是转化成fas格式,应该是转化成meg格式的,然后在进行发育树的构建.
求助:如何将酶切结果保存为fasta格式?
用Seqman软件可以转化,另存为里选Fasta格式就行 再看看别人怎么说的.
从NVBI导出一级蛋白Fasta格式怎样处理可以变成antheprot能识别的信息?
蛋白
文本文档多个核苷酸序列如何转化成FASTA格式?
这个容易,自己稍微手动改些就是了. 你可以随便下一个NCBI的fasta的格式看看.我有点记不清了,按照它的格式来写. 其实差别就是上面多了一个:>XXX之类的. 最后改好后,保存关闭把文件后缀名改一下. 可能有软件可以直接改吧.不知道DNA plus可不可以.上面的方法还是可以的.