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bed格式是什么,bed格式是什么意思

怎样打开BED格式文件

怎样打开BED格式文件

BED 文件格式是一个可变方式的数据线,用来描述注释的数据。建议用plink转换为.map和.ped格式,其中ped文件中的数据就是想要的。用EditPlus打开即可。或者用excel可以打开。

BED线有3个要求的字段和9个额外的字段。每条线的字段数目必须是任意单条数据的在注释上一致。可选字段的序试结合低数字的字段必须流行如果高位字段被使用。

首先是三个要求的BED字段:

1.chrom, 染色体或scafflold 的名字(eg chr3, chrY, chr2_random, scaffold0671 ).

2.chromStart 染色体和scaffold的起始位置,第一个染色体的位置是0.

3.chromEn 染色体和scaffold的结束位置,染色体的末端位置没有包含到显示信息里面。例如,首先得100个碱基的染色体定义为chromStart =0 . chromEnd=100, 碱基的数目是0-99

9 个额外的可选BED 字段是:

1. name 定义BED 的名字

2. score 0到1000的分值,如果track线在注释时属性设置为1,那么这个分值会决定现示灰度水平,数字越大,灰度越高。下面的这个表格显示Genome Browser

3. strand 定义链的”+” 或者”-”

4. thickStart 开始的位置,这个特征是画thickly(例如,在开始的编码显示基因的显示

5. thickEnd 结束的位置,这个特征是画thickly例如,在结束的编码显示基因的显示

6. itemRGB An AGB 值的形式, R, G, B (eg. 255, 0, 0), 如果track line itemRgb属性是设置为’On”, 这个RBG 值将决定数据的显示的颜色在BED 线。 注意,它推荐简单的颜色方案(eight color or less )是用作这个属性避免颜色资源在基因组浏览器上过多

7. blockCount BED线在exon 的block数目

8. blockSize 用逗号分割block size, 这个item的列表对应于BlockCount

9. blockStarts- 用逗号分割的列表, 所有的blockStart位置应该被计算相关于chromStart, 这个数字的项应该对应于blockCount

BED格式,GFF格式是什么样的?

BED格式,GFF格式是什么样的?

awk ‘BEGIN ‘ CTCF.bed > CTCF.GFF

工艺包设计和BED,BED是指什么啊?

工艺包设计和BED,BED是指什么啊?

BED是指基础工程设计 既初步设计 Based engineering design

基因测序时目标区域 bed 文件是包含什么信息?

第一列,目标区域的染色体编号;第二列,目标区域的起始位点;第三列,目标区域的终止位点;之后为个人定义的其他信息.

问:bed复数形式是啥

beds [bedz] n. 床; [例句]We found the beds very comfortable.我们发现这些床非常舒适.

iPhone的bed文件安装

推荐使用同步助手软件试试 简单 方便 易懂.

英语五行诗bed怎么写?

There is a boy whose name is Ted,Classes were where he alwasy fled,Rumour about him spread,that he was hit on the head,But he went home to sleep in bed.

ipad越狱后可以直接网站下载bed格式吗?我下载了一个bed格式怎么也不能打开’是还得装个安装软

1、是deb格式,不是bed… 2、在Cydia中有一个目录,启动时会自动安装里面的deb文件.你在IPAD上装个iTools或者iFunbox,随便哪个都行,然后把从网上下载的deb文件用上述工具复制进去即可.具体目录是/private/var/root/Media/Cydia/AutoInstall/ 然后重启IPAD.deb文件会自动安装,安装后会自动删除.有时候重新启动一次还不行,多试几次即可. 3、最简单的方法!IPAD上装个iFile,然后把deb文件拷到IPAD里,随便哪个位置.拷完你用iFile找到他,点击后就可以直接安装程序,然后重启. 手打…求给分

bed的复数形式是什么?

beds直接+s就行了